Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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EXT1Q16394 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXT1Q16394 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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EXT1Q16394 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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EXT1Q16394 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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EXT1Q16394 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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EXT1Q16394 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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EXT1Q16394 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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EXT1Q16394 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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EXT1Q16394 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EXT1Q16394 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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