Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 NBL1YHR199C-A 222 nt3.85□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YIL012WYIL012W 342 nt3.85□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt3.85□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 SHH3YMR118C 591 nt3.85□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YPL039WYPL039W 951 nt3.85□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YDL242WYDL242W 354 nt3.84□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 RAD6YGL058W 519 nt3.84□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 TPM2YIL138C 486 nt3.84□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 BET3YKR068C 582 nt3.84□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 CDC123YLR215C 1083 nt3.84□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YML084WYML084W 309 nt3.84□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 RAD14YMR201C 1116 nt3.84□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YNL058CYNL058C 951 nt3.84□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YOR053WYOR053W 342 nt3.84□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YOR392WYOR392W 444 nt3.84□□□□□ -1.79
SSF2Q12153 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.84□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.84□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.84□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.84□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.84□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YCL019WYCL019W 5313 nt3.84□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 TIF35YDR429C 825 nt3.83□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YLR269CYLR269C 351 nt3.83□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 LSM2YBL026W 288 nt3.83□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YBR012CYBR012C 420 nt3.83□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YBR032WYBR032W 303 nt3.83□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YBR285WYBR285W 435 nt3.83□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 AVT2YEL064C 1443 nt3.83□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt3.83□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 SWI1YPL016W 3945 nt3.82□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt3.82□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt3.82□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt3.82□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 APC11YDL008W 498 nt3.82□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 SWF1YDR126W 1011 nt3.82□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 COX23YHR116W 456 nt3.82□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 KIN82YCR091W 2163 nt3.82□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 VHR2YER064C 1518 nt3.81□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 BFR1YOR198C 1413 nt3.81□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YTA7YGR270W 4140 nt3.81□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.81□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 GPI17YDR434W 1605 nt3.81□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 SPP382YLR424W 2127 nt3.8□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 STU2YLR045C 2667 nt3.8□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YMR141CYMR141C 309 nt3.8□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 GOT1YMR292W 417 nt3.8□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 DNM1YLL001W 2274 nt3.8□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 ARO1YDR127W 4767 nt3.8□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 TRZ1YKR079C 2517 nt3.8□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 RPA135YPR010C 3612 nt3.8□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 LAG1YHL003C 1236 nt3.79□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YKL066WYKL066W 444 nt3.79□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 ISU1YPL135W 498 nt3.79□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 TSC3YBR058C-A 243 nt3.79□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 REC8YPR007C 2043 nt3.78□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 RNH70YGR276C 1662 nt3.78□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 CCT7YJL111W 1653 nt3.78□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 TAF2YCR042C 4224 nt3.78□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YER107W-AYER107W-A 321 nt3.78□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 GLC7YER133W 939 nt3.78□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YLR287CYLR287C 1068 nt3.78□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YOL134CYOL134C 390 nt3.78□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 YPL197CYPL197C 414 nt3.78□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 AUS1YOR011W 4185 nt3.78□□□□□ -1.8
SSF2Q12153 ABP140YOR239W 1887 nt3.77□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 PRP22YER013W 3438 nt3.77□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 FAP7YDL166C 594 nt3.77□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 PSF1YDR013W 627 nt3.77□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YDR431WYDR431W 312 nt3.77□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.77□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 RPL19BYBL027W 570 nt3.77□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 snR191snR191 274 nt3.77□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 IOC3YFR013W 2364 nt3.76□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 STU1YBL034C 4542 nt3.76□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 SIP3YNL257C 3690 nt3.76□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 PAU23YLR037C 375 nt3.76□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 RPL37AYLR185W 267 nt3.76□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 RPB11YOL005C 363 nt3.76□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.76□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 DGK1YOR311C 873 nt3.76□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 DIA2YOR080W 2199 nt3.76□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 RIX1YHR197W 2292 nt3.75□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 EXO84YBR102C 2262 nt3.75□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 SNF12YNR023W 1701 nt3.75□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 SMC3YJL074C 3693 nt3.75□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 ATG31YDR022C 591 nt3.75□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt3.75□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 TSA2YDR453C 591 nt3.75□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 VOA1YGR106C 798 nt3.75□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 RNR4YGR180C 1038 nt3.75□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YKL100CYKL100C 1764 nt3.75□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YMR317WYMR317W 3423 nt3.74□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 PKH1YDR490C 2301 nt3.74□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 IRC4YDR540C 540 nt3.74□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 RRT13YER066W 558 nt3.74□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 VFA1YER128W 612 nt3.74□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YGL165CYGL165C 579 nt3.74□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.74□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.74□□□□□ -1.81
SSF2Q12153 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.74□□□□□ -1.81
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