Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS1P54277 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS1P54277 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS1P54277 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS1P54277 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS1P54277 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS1P54277 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMS1P54277 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMS1P54277 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMS1P54277 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMS1P54277 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMS1P54277 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMS1P54277 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMS1P54277 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMS1P54277 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMS1P54277 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMS1P54277 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMS1P54277 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PMS1P54277 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PMS1P54277 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PMS1P54277 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PMS1P54277 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PMS1P54277 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PMS1P54277 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PMS1P54277 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS1P54277 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS1P54277 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS1P54277 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS1P54277 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS1P54277 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS1P54277 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS1P54277 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS1P54277 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS1P54277 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS1P54277 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PMS1P54277 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS1P54277 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS1P54277 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS1P54277 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS1P54277 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS1P54277 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PMS1P54277 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms