Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHKA1P46020 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHKA1P46020 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms