Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD21O60216 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD21O60216 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD21O60216 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD21O60216 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD21O60216 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD21O60216 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms