Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCRT1Q9BWW7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCRT1Q9BWW7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms