Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHLDB3Q6NSJ2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHLDB3Q6NSJ2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHLDB3Q6NSJ2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHLDB3Q6NSJ2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHLDB3Q6NSJ2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms