Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NID2Q14112 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NID2Q14112 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NID2Q14112 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NID2Q14112 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NID2Q14112 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NID2Q14112 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NID2Q14112 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NID2Q14112 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NID2Q14112 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NID2Q14112 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NID2Q14112 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NID2Q14112 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NID2Q14112 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
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