Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 VMA9YCL005W-A 222 nt2.11□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 COG3YER157W 2406 nt2.11□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 ALY1YKR021W 2748 nt2.11□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 RGA2YDR379W 3030 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 SNA4YDL123W 423 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 RUB1YDR139C 234 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 YER189WYER189W 369 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 PAU14YIL176C 363 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 YAP5YIR018W 738 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 PAU1YJL223C 363 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 MTG1YMR097C 1104 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 PEX17YNL214W 600 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 ATG19YOL082W 1248 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 YOR366WYOR366W 354 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 SHG1YBR258C 429 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 APL5YPL195W 2799 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 MGM1YOR211C 2646 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 ESA1YOR244W 1338 nt2.1□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 KSP1YHR082C 3090 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 RAV1YJR033C 4074 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 ARP5YNL059C 2268 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 BRE5YNR051C 1548 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 BUD26YDR241W 288 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 GIC2YDR309C 1152 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 ATG10YLL042C 504 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 RPL16BYNL069C 597 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 YOL162WYOL162W 648 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 PET20YPL159C 762 nt2.09□□□□□ -2.07
SNF8Q12483 UBX3YDL091C 1368 nt2.09□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YOL098CYOL098C 3114 nt2.08□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 GPI19YDR437W 423 nt2.08□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 VAB2YEL005C 849 nt2.08□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.08□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 VPS51YKR020W 495 nt2.08□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 UTP30YKR060W 825 nt2.08□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 GRE2YOL151W 1029 nt2.08□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 MBA1YBR185C 837 nt2.08□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 BUB1YGR188C 3066 nt2.08□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YKL075CYKL075C 1353 nt2.08□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 SSE1YPL106C 2082 nt2.08□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 BAS1YKR099W 2436 nt2.08□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 SAP190YKR028W 3102 nt2.08□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 SSD1YDR293C 3753 nt2.07□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 INP53YOR109W 3324 nt2.07□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 GCN4YEL009C 846 nt2.07□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 SVP26YHR181W 687 nt2.07□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YBL062WYBL062W 381 nt2.07□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 ATX1YNL259C 222 nt2.07□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 CUP9YPL177C 921 nt2.07□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 snR24snR24 89 nt2.07□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 PEX34YCL056C 435 nt2.07□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.07□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 SPT14YPL175W 1359 nt2.07□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 SIP3YNL257C 3690 nt2.07□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 ADK1YDR226W 669 nt2.06□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YER138W-AYER138W-A 105 nt2.06□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YHR022CYHR022C 771 nt2.06□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 CTK2YJL006C 972 nt2.06□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 PAU8YAL068C 363 nt2.06□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YLR257WYLR257W 966 nt2.06□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 ECI1YLR284C 843 nt2.06□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt2.06□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 PAU20YOL161C 363 nt2.06□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 PEX27YOR193W 1131 nt2.06□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 VPS41YDR080W 2979 nt2.06□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 PSK2YOL045W 3306 nt2.06□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YEL043WYEL043W 2871 nt2.05□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 UBR1YGR184C 5853 nt2.05□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 UTP22YGR090W 3714 nt2.05□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 CBS2YDR197W 1170 nt2.05□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 SDC1YDR469W 528 nt2.05□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 CUP1-1YHR053C 186 nt2.05□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 CUP1-2YHR055C 186 nt2.05□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 RRT16YNL105W 429 nt2.05□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 DGR1YNL130C-A 147 nt2.05□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 BFR1YOR198C 1413 nt2.05□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 GPI17YDR434W 1605 nt2.05□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 SMC6YLR383W 3345 nt2.05□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 GIP3YPL137C 3831 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YCR090CYCR090C 549 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YDR203WYDR203W 318 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 SPP41YDR464W 4308 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 OST5YGL226C-A 261 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 ACB1YGR037C 264 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 CKA1YIL035C 1119 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 ASG7YJL170C 630 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YLL044WYLL044W 447 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 ALK2YBL009W 2031 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YIP3YNL044W 531 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 SGT1YOR057W 1188 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 SEC66YBR171W 621 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 STH1YIL126W 4080 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 CBF2YGR140W 2871 nt2.04□□□□□ -2.08
SNF8Q12483 YJL181WYJL181W 1836 nt2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.6 ms