Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 YDR442WYDR442W 393 nt3.17□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 RTS3YGR161C 792 nt3.17□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 BIG1YHR101C 1008 nt3.17□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 MCR1YKL150W 909 nt3.17□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 RPS21AYKR057W 264 nt3.17□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 HRI1YLR301W 735 nt3.17□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 YML108WYML108W 318 nt3.17□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 MUS81YDR386W 1899 nt3.17□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 SEC15YGL233W 2733 nt3.17□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 MIT1YEL007W 2001 nt3.17□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 STE6YKL209C 3873 nt3.17□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 HAA1YPR008W 2085 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 RPL1BYGL135W 654 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 YIL175WYIL175W 318 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 VPH2YKL119C 648 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 CMS1YLR003C 876 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 ADI1YMR009W 540 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 TIF11YMR260C 462 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 NOP15YNL110C 663 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 RPL1AYPL220W 654 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 ARR2YPR200C 393 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 snR54snR54 86 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 ATP25YMR098C 1839 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 RRP5YMR229C 5190 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 CBP2YHL038C 1893 nt3.16□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 VTC4YJL012C 2166 nt3.15□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 CIN1YOR349W 3045 nt3.15□□□□□ -1.9
LCB4Q12246 PSF1YDR013W 627 nt3.15□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YEL057CYEL057C 702 nt3.15□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 USE1YGL098W 738 nt3.15□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt3.15□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt3.15□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YPL216WYPL216W 3309 nt3.15□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 RUD3YOR216C 1455 nt3.15□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 CHA4YLR098C 1947 nt3.15□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 RIF1YBR275C 5751 nt3.14□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 RPA190YOR341W 4995 nt3.14□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YDR269CYDR269C 324 nt3.14□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YER006C-AYER006C-A 318 nt3.14□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YJL169WYJL169W 369 nt3.14□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.14□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 MRP49YKL167C 414 nt3.14□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YLR101CYLR101C 396 nt3.14□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt3.14□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 EPL1YFL024C 2499 nt3.14□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 FLO9YAL063C 3969 nt3.14□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 SSF2YDR312W 1362 nt3.13□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 GDI1YER136W 1356 nt3.13□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 NMD2YHR077C 3270 nt3.13□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 RAD5YLR032W 3510 nt3.13□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YCR090CYCR090C 549 nt3.13□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YER091C-AYER091C-A 222 nt3.13□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt3.13□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 RRT16YNL105W 429 nt3.13□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YBR209WYBR209W 318 nt3.13□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 ZDS2YML109W 2829 nt3.13□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 ENA2YDR039C 3276 nt3.13□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 ENA1YDR040C 3276 nt3.13□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 CDC55YGL190C 1581 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 FAA2YER015W 2235 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 MRH1YDR033W 963 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 RTR1YER139C 681 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YGR242WYGR242W 309 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 OTU2YHL013C 924 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 MRP8YKL142W 660 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YKL222CYKL222C 2118 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YAR047CYAR047C 321 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 COA4YLR218C 453 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 ARV1YLR242C 966 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YOR029WYOR029W 336 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 OST2YOR103C 393 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 BYE1YKL005C 1785 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 CEP3YMR168C 1827 nt3.12□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 AUS1YOR011W 4185 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 SSP1YHR184W 1716 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 PWP2YCR057C 2772 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 JJJ2YJL162C 1752 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YDR431WYDR431W 312 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YER079WYER079W 633 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YAL037WYAL037W 804 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 RPL8BYLL045C 771 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 PEX11YOL147C 711 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YOR248WYOR248W 303 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 MSS18YPR134W 807 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 VID24YBR105C 1089 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YCK2YNL154C 1641 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 PDS5YMR076C 3834 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 CIN8YEL061C 3003 nt3.11□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YME2YMR302C 2553 nt3.1□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.1□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YER087C-AYER087C-A 552 nt3.1□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YGL042CYGL042C 306 nt3.1□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 ERV1YGR029W 570 nt3.1□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 LSM1YJL124C 519 nt3.1□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 SPC1YJR010C-A 285 nt3.1□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.1□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 PKR1YMR123W 369 nt3.1□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YOL159CYOL159C 516 nt3.1□□□□□ -1.91
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