Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 SPT10YJL127C 1923 nt5.4□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 CDC48YDL126C 2508 nt5.4□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 YDL199CYDL199C 2064 nt5.4□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 ILV5YLR355C 1188 nt5.4□□□□□ -1.54
NCR1Q12200 PHO90YJL198W 2646 nt5.4□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 EXO1YOR033C 2109 nt5.39□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 RAD53YPL153C 2466 nt5.39□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 SNX41YDR425W 1878 nt5.39□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 SSQ1YLR369W 1974 nt5.39□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt5.39□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YAP1802YGR241C 1707 nt5.39□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 AAP1YHR047C 2571 nt5.39□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 FRE3YOR381W 2136 nt5.38□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YPL260WYPL260W 1656 nt5.38□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 FMP10YER182W 735 nt5.38□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.38□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 RDN58-1RDN58-1 158 nt5.38□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 RDN58-2RDN58-2 158 nt5.38□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YOR015WYOR015W 360 nt5.38□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YHR182WYHR182W 2358 nt5.37□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 CYK3YDL117W 2658 nt5.37□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 snR60snR60 104 nt5.37□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 MIM2YLR099W-A 264 nt5.37□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 OPY2YPR075C 1083 nt5.37□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 SFI1YLL003W 2841 nt5.37□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 CAB3YKL088W 1716 nt5.37□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 MNT3YIL014W 1893 nt5.37□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 OCA5YHL029C 2040 nt5.36□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 FMP32YFL046W 624 nt5.36□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt5.36□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 RPS21BYJL136C 264 nt5.36□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt5.36□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YER158CYER158C 1722 nt5.36□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 GDB1YPR184W 4611 nt5.36□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 SSY5YJL156C 2100 nt5.35□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 HDA2YDR295C 2025 nt5.35□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 ARX1YDR101C 1782 nt5.35□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YHR078WYHR078W 1659 nt5.35□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YNL193WYNL193W 1677 nt5.35□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 DIB1YPR082C 432 nt5.35□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 HDA3YPR179C 1968 nt5.35□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 HPA3YEL066W 540 nt5.34□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YER187WYER187W 426 nt5.34□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 ULI1YFR026C 510 nt5.34□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt5.34□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 LSM2YBL026W 288 nt5.34□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YBR099CYBR099C 384 nt5.34□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YBR259WYBR259W 2067 nt5.34□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 NOP2YNL061W 1857 nt5.34□□□□□ -1.55
NCR1Q12200 YJR030CYJR030C 2238 nt5.33□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 RPC11YDR045C 333 nt5.33□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 YDR340WYDR340W 303 nt5.33□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 SAE3YHR079C-A 276 nt5.33□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 YNL028WYNL028W 318 nt5.33□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt5.33□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 TPA1YER049W 1935 nt5.33□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 SOF1YLL011W 1470 nt5.32□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 CBF5YLR175W 1452 nt5.32□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 CTM1YHR109W 1758 nt5.32□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 SWA2YDR320C 2007 nt5.32□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt5.32□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 YGR242WYGR242W 309 nt5.32□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 FBP1YLR377C 1047 nt5.32□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 EGD1YPL037C 474 nt5.32□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 ADE3YGR204W 2841 nt5.32□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 FOB1YDR110W 1701 nt5.31□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 CTR86YCR054C 1692 nt5.31□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 ARN2YHL047C 1863 nt5.31□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 YDL011CYDL011C 324 nt5.31□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 MVB12YGR206W 306 nt5.31□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 HSP10YOR020C 321 nt5.31□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 PIS1YPR113W 663 nt5.31□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt5.31□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 MCH4YOL119C 1506 nt5.31□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 PDR10YOR328W 4695 nt5.31□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 PFK26YIL107C 2484 nt5.31□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 TYW1YPL207W 2433 nt5.31□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 ATM1YMR301C 2073 nt5.3□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 MIT1YEL007W 2001 nt5.3□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt5.3□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 RPL6AYML073C 531 nt5.3□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 RPL36AYMR194W 303 nt5.3□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 SRP72YPL210C 1923 nt5.29□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 RPS29BYDL061C 171 nt5.29□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 GPP2YER062C 753 nt5.29□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 RPS4AYJR145C 786 nt5.29□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 TDA5YLR426W 981 nt5.29□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 snR32snR32 188 nt5.29□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 SMY1YKL079W 1971 nt5.29□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 LEU1YGL009C 2340 nt5.29□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 NTH2YBR001C 2343 nt5.29□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 TPD3YAL016W 1908 nt5.29□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 SYO1YDL063C 1863 nt5.28□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 PTR3YFR029W 2037 nt5.28□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 snR68snR68 136 nt5.28□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 YER188C-AYER188C-A 300 nt5.28□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 BCD1YHR040W 1101 nt5.28□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 DOA1YKL213C 2148 nt5.28□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 PAU23YLR037C 375 nt5.28□□□□□ -1.56
NCR1Q12200 TSL1YML100W 3297 nt5.27□□□□□ -1.57
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