Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 SWC3YAL011W 1878 nt5.07□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 VID30YGL227W 2877 nt5.06□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 ROT2YBR229C 2865 nt5.06□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 BCD1YHR040W 1101 nt5.06□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 YIL102CYIL102C 306 nt5.06□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 RAD27YKL113C 1149 nt5.06□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.06□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt5.06□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 MCH4YOL119C 1506 nt5.06□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 SGO1YOR073W 1773 nt5.06□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 YLR001CYLR001C 2589 nt5.06□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 DBP6YNR038W 1890 nt5.05□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 ATH1YPR026W 3636 nt5.05□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 HTA1YDR225W 399 nt5.05□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 KRI1YNL308C 1776 nt5.05□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 ATP22YDR350C 2055 nt5.04□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 YAP1802YGR241C 1707 nt5.04□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt5.04□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 FRQ1YDR373W 573 nt5.04□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 YER188C-AYER188C-A 300 nt5.04□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 SHH3YMR118C 591 nt5.04□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 ORC2YBR060C 1863 nt5.04□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 ECM25YJL201W 1800 nt5.04□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 YMR102CYMR102C 2505 nt5.03□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 LCB4YOR171C 1875 nt5.03□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 FZO1YBR179C 2568 nt5.03□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 MZM1YDR493W 372 nt5.03□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 PAU2YEL049W 363 nt5.03□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 RPC10YHR143W-A 213 nt5.03□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt5.03□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 YEL1YBL060W 2064 nt5.03□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 SYF1YDR416W 2580 nt5.03□□□□□ -1.6
YRR1Q12172 SMI1YGR229C 1518 nt5.02□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 PTR3YFR029W 2037 nt5.02□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 AVT1YJR001W 1809 nt5.02□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 GLN4YOR168W 2430 nt5.02□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 MCX1YBR227C 1563 nt5.02□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 PUT2YHR037W 1728 nt5.02□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 MPS3YJL019W 2049 nt5.01□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 ARG2YJL071W 1725 nt5.01□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 OAF1YAL051W 3144 nt5.01□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 MRP10YDL045W-A 288 nt5.01□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 RPL29YFR032C-A 180 nt5.01□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 DOA1YKL213C 2148 nt5.01□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 RPL36BYPL249C-A 303 nt5.01□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 ELP2YGR200C 2367 nt5.01□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 SIN4YNL236W 2925 nt5.01□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 HIR2YOR038C 2628 nt5.01□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 YDR061WYDR061W 1620 nt5.01□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 DBF4YDR052C 2115 nt5□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 VAC14YLR386W 2643 nt5□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 YCR023CYCR023C 1836 nt5□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 CDC26YFR036W 375 nt5□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 YKL111CYKL111C 336 nt5□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 RPL37AYLR185W 267 nt5□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 YNL057WYNL057W 333 nt5□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt5□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 EMP70YLR083C 2004 nt5□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 YBR238CYBR238C 2196 nt4.99□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 GCN20YFR009W 2259 nt4.99□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 CYK3YDL117W 2658 nt4.99□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 DAD4YDR320C-A 219 nt4.99□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 RPS26BYER131W 360 nt4.99□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 OLI1Q0130 231 nt4.99□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 SAE3YHR079C-A 276 nt4.99□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 HTB2YBL002W 396 nt4.99□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 SUI1YNL244C 327 nt4.99□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 NNK1YKL171W 2787 nt4.99□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 MDM32YOR147W 1869 nt4.98□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 IRC3YDR332W 2070 nt4.98□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 RPL14BYHL001W 417 nt4.98□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt4.98□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 YKL222CYKL222C 2118 nt4.98□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 NUT2YPR168W 474 nt4.98□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 FLC1YPL221W 2382 nt4.98□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 TIF4631YGR162W 2859 nt4.98□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 SAF1YBR280C 1914 nt4.97□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 GRS1YBR121C 2004 nt4.97□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 TDA1YMR291W 1761 nt4.97□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 ECT1YGR007W 972 nt4.97□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 YMR326CYMR326C 309 nt4.97□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt4.97□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 BUD5YCR038C 1929 nt4.97□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 TPO2YGR138C 1845 nt4.97□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 FRE4YNR060W 2160 nt4.97□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 RIM20YOR275C 1986 nt4.96□□□□□ -1.61
YRR1Q12172 YDL011CYDL011C 324 nt4.96□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 MTC3YGL226W 372 nt4.96□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 YJR085CYJR085C 318 nt4.96□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 LSM2YBL026W 288 nt4.96□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 YDR544CYDR544C 429 nt4.95□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 YBL028CYBL028C 321 nt4.95□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 SWD3YBR175W 948 nt4.95□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 FAP1YNL023C 2898 nt4.95□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 SED4YCR067C 3198 nt4.95□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 OCA5YHL029C 2040 nt4.94□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 EPO1YMR124W 2832 nt4.94□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 MSC2YDR205W 2175 nt4.94□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt4.94□□□□□ -1.62
YRR1Q12172 YER187WYER187W 426 nt4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.3 ms