Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PMS1P54277 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PMS1P54277 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PMS1P54277 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PMS1P54277 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PMS1P54277 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PMS1P54277 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PMS1P54277 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS1P54277 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS1P54277 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS1P54277 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS1P54277 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS1P54277 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS1P54277 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PMS1P54277 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms