Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YMR320WYMR320W 306 nt2.14□□□□□ -2.07
DDI1P40087 GRE2YOL151W 1029 nt2.14□□□□□ -2.07
DDI1P40087 snR24snR24 89 nt2.14□□□□□ -2.07
DDI1P40087 HRD3YLR207W 2502 nt2.13□□□□□ -2.07
DDI1P40087 INP51YIL002C 2841 nt2.13□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YRB1YDR002W 606 nt2.13□□□□□ -2.07
DDI1P40087 GPI19YDR437W 423 nt2.13□□□□□ -2.07
DDI1P40087 RPL11BYGR085C 525 nt2.13□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.13□□□□□ -2.07
DDI1P40087 SVP26YHR181W 687 nt2.13□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.13□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YLL044WYLL044W 447 nt2.13□□□□□ -2.07
DDI1P40087 RPL16BYNL069C 597 nt2.13□□□□□ -2.07
DDI1P40087 RPL25YOL127W 429 nt2.13□□□□□ -2.07
DDI1P40087 RPL11AYPR102C 525 nt2.13□□□□□ -2.07
DDI1P40087 ROY1YMR258C 1662 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 BFR1YOR198C 1413 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 CBS2YDR197W 1170 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 TIF35YDR429C 825 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YER138W-AYER138W-A 105 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 GET1YGL020C 708 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 CUP1-1YHR053C 186 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 CUP1-2YHR055C 186 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 AYR1YIL124W 894 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YLR257WYLR257W 966 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 ECI1YLR284C 843 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 SEC66YBR171W 621 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 SHG1YBR258C 429 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 SLK19YOR195W 2466 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 ELG1YOR144C 2376 nt2.12□□□□□ -2.07
DDI1P40087 ALY1YKR021W 2748 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 ESC2YDR363W 1371 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 SPT14YPL175W 1359 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 NAB6YML117W 3405 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 SRP1YNL189W 1629 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 SRB7YDR308C 423 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 TIM9YEL020W-A 264 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 OST5YGL226C-A 261 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 TWF1YGR080W 999 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 CKA1YIL035C 1119 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 CTK2YJL006C 972 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 RNP1YLL046C 750 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YNL046WYNL046W 519 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 RRT16YNL105W 429 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 UBP16YPL072W 1500 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YFR016CYFR016C 3702 nt2.11□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YCR090CYCR090C 549 nt2.1□□□□□ -2.07
DDI1P40087 VPS41YDR080W 2979 nt2.1□□□□□ -2.07
DDI1P40087 ATC1YDR184C 885 nt2.1□□□□□ -2.07
DDI1P40087 TMN3YER113C 2121 nt2.1□□□□□ -2.07
DDI1P40087 HSC82YMR186W 2118 nt2.1□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YIP3YNL044W 531 nt2.1□□□□□ -2.07
DDI1P40087 PEX27YOR193W 1131 nt2.1□□□□□ -2.07
DDI1P40087 UFD4YKL010C 4452 nt2.1□□□□□ -2.07
DDI1P40087 UBX3YDL091C 1368 nt2.1□□□□□ -2.07
DDI1P40087 RGA2YDR379W 3030 nt2.09□□□□□ -2.07
DDI1P40087 CST9YLR394W 1449 nt2.09□□□□□ -2.07
DDI1P40087 RGL1YPL066W 1440 nt2.09□□□□□ -2.07
DDI1P40087 TFC3YAL001C 3483 nt2.09□□□□□ -2.07
DDI1P40087 SPP41YDR464W 4308 nt2.09□□□□□ -2.07
DDI1P40087 snR70snR70 164 nt2.09□□□□□ -2.07
DDI1P40087 ADK1YDR226W 669 nt2.09□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YEA4YEL004W 1029 nt2.09□□□□□ -2.07
DDI1P40087 GLC7YER133W 939 nt2.09□□□□□ -2.07
DDI1P40087 YPT52YKR014C 705 nt2.09□□□□□ -2.07
DDI1P40087 SGT1YOR057W 1188 nt2.09□□□□□ -2.07
DDI1P40087 GPI17YDR434W 1605 nt2.09□□□□□ -2.08
DDI1P40087 UBP2YOR124C 3819 nt2.09□□□□□ -2.08
DDI1P40087 TRZ1YKR079C 2517 nt2.09□□□□□ -2.08
DDI1P40087 SSP1YHR184W 1716 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 NGG1YDR176W 2109 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 UBC13YDR092W 462 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YDR262WYDR262W 819 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YER189WYER189W 369 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YHR022CYHR022C 771 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 AIM23YJL131C 1071 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 RFA3YJL173C 369 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 GPX1YKL026C 504 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 PAU8YAL068C 363 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 NEJ1YLR265C 1029 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 PAU20YOL161C 363 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 RRP15YPR143W 753 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 snR43snR43 209 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YDR338CYDR338C 2088 nt2.08□□□□□ -2.08
DDI1P40087 INO80YGL150C 4470 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 RAV1YJR033C 4074 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 YFH1YDL120W 525 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 COG2YGR120C 789 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 LSM12YHR121W 564 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.07□□□□□ -2.08
DDI1P40087 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.5 ms