Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP69A5D8W1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP69A5D8W1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms