Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BEST4Q8NFU0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BEST4Q8NFU0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms