Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SOHLH1Q5JUK2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms