Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME3Q16798 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ME3Q16798 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ME3Q16798 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ME3Q16798 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ME3Q16798 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms