Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SMAD1Q15797 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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