Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YJR020WYJR020W 333 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 FUS2YMR232W 2034 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 ASI3YNL008C 2031 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 BUB1YGR188C 3066 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 OTU2YHL013C 924 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 RPS22AYJL190C 393 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 CPR7YJR032W 1182 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 FPR1YNL135C 345 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 ESA1YOR244W 1338 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 SMY2YBR172C 2223 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 CDC20YGL116W 1833 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 NEW1YPL226W 3591 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YKU80YMR106C 1890 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 NGG1YDR176W 2109 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YIL012WYIL012W 342 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YKL069WYKL069W 543 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 ISU1YPL135W 498 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 snR191snR191 274 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YBR287WYBR287W 1284 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 SPB1YCL054W 2526 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YDR239CYDR239C 2364 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 PFF1YBR074W 2931 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 RIM13YMR154C 2184 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 CST9YLR394W 1449 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 MAL33YBR297W 1407 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 DNA2YHR164C 4569 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YPL216WYPL216W 3309 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 DNL4YOR005C 2835 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 FAR11YNL127W 2862 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 YEL1YBL060W 2064 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 KEI1YDR367W 666 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 RMD6YEL072W 696 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 SPO11YHL022C 1197 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 RPS29AYLR388W 171 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 snR24snR24 89 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 NEL1YHR035W 1893 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP46Q12417 KIN82YCR091W 2163 nt2.34□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 AMS1YGL156W 3252 nt2.34□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 NUR1YDL089W 1455 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 ORC2YBR060C 1863 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YDR209CYDR209C 414 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YFL012WYFL012W 447 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 BTN2YGR142W 1233 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 MRP49YKL167C 414 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 ATG10YLL042C 504 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YLR050CYLR050C 486 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YKE2YLR200W 345 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 RPL16BYNL069C 597 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YOL107WYOL107W 1029 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YRO2YBR054W 1035 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 ACM1YPL267W 630 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 PIS1YPR113W 663 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 NTC20YBR188C 423 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 snR43snR43 209 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 NAB3YPL190C 2409 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 BCK1YJL095W 4437 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 TRA1YHR099W 11235 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 FUS1YCL027W 1539 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YDR186CYDR186C 2634 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 SAP1YER047C 2694 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 ARP5YNL059C 2268 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YMR31YFR049W 372 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YIP5YGL161C 933 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YAL037WYAL037W 804 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 NYV1YLR093C 762 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YLR217WYLR217W 324 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YNL050CYNL050C 813 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 CRS5YOR031W 210 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 HEM4YOR278W 828 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 PDR3YBL005W 2931 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 NSA1YGL111W 1392 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 RPO41YFL036W 4056 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 SRP1YNL189W 1629 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 SWA2YDR320C 2007 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 HAA1YPR008W 2085 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YDL158CYDL158C 309 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 snR83snR83 306 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 UBC13YDR092W 462 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 STE2YFL026W 1296 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YKL115CYKL115C 393 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 YLR257WYLR257W 966 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 URA5YML106W 681 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 IRC21YMR073C 606 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 ATP20YPR020W 348 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 PSD2YGR170W 3417 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 TCB2YNL087W 3537 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 BRE5YNR051C 1548 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 SDC25YLL016W 3147 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 KRE33YNL132W 3171 nt2.3□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 snR76snR76 109 nt2.3□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 SLD5YDR489W 885 nt2.3□□□□□ -2.04
PRP46Q12417 VAB2YEL005C 849 nt2.3□□□□□ -2.04
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