Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 CDC25YLR310C 4770 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 IST2YBR086C 2841 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YDR115WYDR115W 318 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YGL069CYGL069C 465 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YPR078CYPR078C 1119 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 RRP42YDL111C 798 nt1.71□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 RGL1YPL066W 1440 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 YLR076CYLR076C 423 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 DFG16YOR030W 1860 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 BIR1YJR089W 2865 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 VMA22YHR060W 546 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 RLP24YLR009W 600 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 RLP7YNL002C 969 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 YNL203CYNL203C 612 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 RPN5YDL147W 1338 nt1.69□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 GAS2YLR343W 1668 nt1.69□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 RTT105YER104W 627 nt1.69□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 PEX12YMR026C 1200 nt1.69□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 YKL100CYKL100C 1764 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 PKH2YOL100W 3246 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 RAV2YDR202C 1056 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 PAM16YJL104W 450 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 HSP10YOR020C 321 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 ATG9YDL149W 2994 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 NOP56YLR197W 1515 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 RIF1YBR275C 5751 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 ULP2YIL031W 3105 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 YSP1YHR155W 3687 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 YGR011WYGR011W 327 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 YMR321CYMR321C 318 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 YMR1YJR110W 2067 nt1.66□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 SET4YJL105W 1683 nt1.66□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 YIL080WYIL080W 4722 nt1.66□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 FMP16YDR070C 282 nt1.66□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 MIG2YGL209W 1149 nt1.66□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 EFG1YGR271C-A 702 nt1.66□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 RPS0BYLR048W 759 nt1.65□□□□□ -2.14
TY1B-BRQ12193 AIM14YGL160W 1713 nt1.65□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 MGA1YGR249W 1371 nt1.65□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 IME1YJR094C 1083 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 COQ10YOL008W 624 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 UBP16YPL072W 1500 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 UTP6YDR449C 1323 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 KDX1YKL161C 1302 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 VMR1YHL035C 4779 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 SPT14YPL175W 1359 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 HTA2YBL003C 399 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 ATX2YOR079C 942 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 RKM1YPL208W 1752 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 MAD1YGL086W 2250 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 AVT2YEL064C 1443 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 YGR117CYGR117C 1431 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 MYO2YOR326W 4725 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 GCN2YDR283C 4980 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 YLR366WYLR366W 306 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 YNL109WYNL109W 546 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 PMI40YER003C 1290 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 TAZ1YPR140W 1146 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 SRO9YCL037C 1305 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 PTC5YOR090C 1719 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 SWI4YER111C 3282 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 ANR2YKL047W 1551 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 OTU2YHL013C 924 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 RPA34YJL148W 702 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 EAP1YKL204W 1899 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 YNL018CYNL018C 1839 nt1.59□□□□□ -2.15
TY1B-BRQ12193 GPI17YDR434W 1605 nt1.59□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 YPS5YGL259W 498 nt1.59□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 PCL5YHR071W 690 nt1.59□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 TPP1YMR156C 717 nt1.59□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 CDC39YCR093W 6327 nt1.59□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 SPT7YBR081C 3999 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 YVC1YOR087W 2028 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 SCC2YDR180W 4482 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 IRC6YFR043C 714 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 YET1YKL065C 621 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 VPS71YML041C 843 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 PSP1YDR505C 2526 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 IMG2YCR071C 441 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 YFH7YFR007W 1062 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 APA1YCL050C 966 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 YMR160WYMR160W 2451 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 MRPL49YJL096W 486 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 IQG1YPL242C 4488 nt1.55□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 NAM7YMR080C 2916 nt1.55□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 UIP3YAR027W 708 nt1.55□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 PRM9YAR031W 897 nt1.55□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 NRG1YDR043C 696 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 YDR336WYDR336W 945 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 GRE2YOL151W 1029 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 MRPL6YHR147C 645 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 YPT52YKR014C 705 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 YBL081WYBL081W 1107 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1B-BRQ12193 YDL211CYDL211C 1119 nt1.53□□□□□ -2.16
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