Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RUNX1Q01196 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms