Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QLW9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QLW9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QLW9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QLW9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QLW9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QLW9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
J3QLW9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
J3QLW9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
J3QLW9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
J3QLW9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
J3QLW9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QLW9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms