Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARID3CA6NKF2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARID3CA6NKF2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms