Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VPREB3Q9UKI3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms