Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHLDB3Q6NSJ2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHLDB3Q6NSJ2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHLDB3Q6NSJ2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHLDB3Q6NSJ2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHLDB3Q6NSJ2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHLDB3Q6NSJ2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHLDB3Q6NSJ2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHLDB3Q6NSJ2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHLDB3Q6NSJ2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHLDB3Q6NSJ2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms