Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL24A1Q17RW2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL24A1Q17RW2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
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