Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME3Q16798 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME3Q16798 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ME3Q16798 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME3Q16798 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME3Q16798 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ME3Q16798 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ME3Q16798 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME3Q16798 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME3Q16798 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME3Q16798 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME3Q16798 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME3Q16798 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME3Q16798 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME3Q16798 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME3Q16798 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME3Q16798 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME3Q16798 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ME3Q16798 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME3Q16798 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME3Q16798 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME3Q16798 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME3Q16798 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ME3Q16798 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ME3Q16798 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ME3Q16798 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME3Q16798 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME3Q16798 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME3Q16798 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME3Q16798 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME3Q16798 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME3Q16798 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME3Q16798 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME3Q16798 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME3Q16798 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME3Q16798 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms