Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 HHF1YBR009C 312 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 MED1YPR070W 1701 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 AFI1YOR129C 2682 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 FYV8YGR196C 2454 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 ZRG17YNR039C 1818 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 CTR86YCR054C 1692 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 CDC53YDL132W 2448 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 INP1YMR204C 1263 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 INP51YIL002C 2841 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 PET309YLR067C 2898 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 NEM1YHR004C 1341 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 ALG11YNL048W 1647 nt1.87□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 HFM1YGL251C 3564 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 PUF2YPR042C 3228 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 UBC6YER100W 753 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 SHE2YKL130C 741 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 RMP1YLR145W 606 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 SUB1YMR039C 879 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 RDS2YPL133C 1341 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 SPO13YHR014W 876 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 PPE1YHR075C 1203 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 ESF2YNR054C 951 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 ALG8YOR067C 1734 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 HIT1YJR055W 495 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 IRC21YMR073C 606 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 YOL166CYOL166C 339 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 TOM1YDR457W 9807 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 SPO22YIL073C 2928 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 MET18YIL128W 3099 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1B-BRQ12193 YER085CYER085C 522 nt1.84□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 YGR242WYGR242W 309 nt1.84□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 YIR043CYIR043C 693 nt1.84□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 DBP5YOR046C 1449 nt1.84□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.83□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 YGR160WYGR160W 612 nt1.83□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 UBR1YGR184C 5853 nt1.83□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 SVS1YPL163C 783 nt1.83□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 BDP1YNL039W 1785 nt1.83□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 HMLALPHA1YCL066W 528 nt1.82□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 MATALPHA1YCR040W 528 nt1.82□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 RPN9YDR427W 1182 nt1.82□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 VMA10YHR039C-A 345 nt1.82□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 SPC3YLR066W 555 nt1.82□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 NDJ1YOL104C 1059 nt1.82□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 RPL33BYOR234C 324 nt1.82□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 CTP1YBR291C 900 nt1.82□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 KCS1YDR017C 3153 nt1.82□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 TIM9YEL020W-A 264 nt1.81□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 DDI2YFL061W 678 nt1.81□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 IOC4YMR044W 1428 nt1.81□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 URB2YJR041C 3525 nt1.81□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 KEI1YDR367W 666 nt1.8□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 YJL119CYJL119C 324 nt1.8□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt1.8□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 YEL1YBL060W 2064 nt1.8□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 YIL166CYIL166C 1629 nt1.8□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 FIR1YER032W 2631 nt1.8□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.8□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 PEX14YGL153W 1026 nt1.8□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 FMC1YIL098C 468 nt1.8□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 CDA2YLR308W 939 nt1.79□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 YPL071CYPL071C 471 nt1.79□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 OST5YGL226C-A 261 nt1.78□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 REV7YIL139C 738 nt1.78□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 YOL162WYOL162W 648 nt1.78□□□□□ -2.12
TY1B-BRQ12193 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.77□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.77□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 BEM2YER155C 6504 nt1.77□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YGL193CYGL193C 312 nt1.77□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 SUR1YPL057C 1149 nt1.77□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YBR134WYBR134W 402 nt1.77□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 RRP8YDR083W 1179 nt1.76□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 LIP2YLR239C 987 nt1.76□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YNL046WYNL046W 519 nt1.76□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 MES1YGR264C 2256 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 MNT3YIL014W 1893 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YBR238CYBR238C 2196 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 PRP16YKR086W 3216 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 COS12YGL263W 1143 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YHR097CYHR097C 1101 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 MSL1YIR009W 336 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 HCH1YNL281W 462 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 SLM4YBR077C 489 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YNL011CYNL011C 1335 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 SPE1YKL184W 1401 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 ENP2YGR145W 2124 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YNL228WYNL228W 777 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YOL134CYOL134C 390 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YIL086CYIL086C 309 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 CBP6YBR120C 489 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 HKR1YDR420W 5409 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 MTL1YGR023W 1656 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 NPR1YNL183C 2373 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 IPT1YDR072C 1584 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 RLF2YPR018W 1821 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 MAK5YBR142W 2322 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 YGL117WYGL117W 798 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1B-BRQ12193 HTD2YHR067W 843 nt1.72□□□□□ -2.13
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