Protein–RNA interactions for Protein: P35736

YKL050C, Uncharacterized protein YKL050C, yeast

Predictions only

Length 922 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	P35736	SHE9	YDR393W	1371 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	RPN1	YHR027C	2982 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	LST4	YKL176C	2487 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	JIP5	YPR169W	1479 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YDR061W	YDR061W	1620 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	NMD2	YHR077C	3270 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	SRD1	YCR018C	666 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	VMA8	YEL051W	771 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	AVT2	YEL064C	1443 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	FLO5	YHR211W	3228 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YAP5	YIR018W	738 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YJL169W	YJL169W	369 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	CUR1	YPR158W	759 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	SNQ2	YDR011W	4506 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	SPO71	YDR104C	3738 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	DRS2	YAL026C	4068 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	SPO14	YKR031C	5052 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YDR210W-B	YDR210W-B	5313 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YDR261W-B	YDR261W-B	5313 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YFL002W-A	YFL002W-A	5313 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YGR161W-B	YGR161W-B	5313 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YLR410W-B	YLR410W-B	5313 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YCL019W	YCL019W	5313 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YDL180W	YDL180W	1644 nt		3.22	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	FUN30	YAL019W	3396 nt		3.22	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YAT2	YER024W	2772 nt		3.22	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	DAD1	YDR016C	285 nt		3.22	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YDR018C	YDR018C	1191 nt		3.22	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	THG1	YGR024C	714 nt		3.22	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	PRS3	YHL011C	963 nt		3.22	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YHR214C-D	YHR214C-D	294 nt		3.22	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YAR069C	YAR069C	294 nt		3.22	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	YLR456W	YLR456W	615 nt		3.22	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	RCN2	YOR220W	798 nt		3.22	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	ITC1	YGL133W	3795 nt		3.22	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	URB2	YJR041C	3525 nt		3.22	□□□□□ -1.89
YKL050C	P35736	KHA1	YJL094C	2622 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	snR9	snR9	187 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YDR262W	YDR262W	819 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	BAT1	YHR208W	1182 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	APQ13	YJL075C	417 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YJL119C	YJL119C	324 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	RPL17B	YJL177W	555 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YKR051W	YKR051W	1257 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	SRL3	YKR091W	741 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YBL039W-B	YBL039W-B	180 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	MPD2	YOL088C	834 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	CSM4	YPL200W	471 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	JID1	YPR061C	906 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	STE23	YLR389C	3084 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	FAA2	YER015W	2235 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	ATP22	YDR350C	2055 nt		3.21	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	FAR1	YJL157C	2493 nt		3.2	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	SYO1	YDL063C	1863 nt		3.2	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	BRE5	YNR051C	1548 nt		3.2	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	HEH2	YDR458C	1992 nt		3.2	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	NTF2	YER009W	378 nt		3.2	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YGR017W	YGR017W	894 nt		3.2	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	ASG7	YJL170C	630 nt		3.2	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		3.2	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	SRP21	YKL122C	504 nt		3.2	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	ATX1	YNL259C	222 nt		3.2	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	VHR1	YIL056W	1923 nt		3.2	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	ASI3	YNL008C	2031 nt		3.2	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	RGR1	YLR071C	3249 nt		3.2	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	SLK19	YOR195W	2466 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	DOA4	YDR069C	2781 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	GCD6	YDR211W	2139 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YDL016C	YDL016C	303 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	CPR5	YDR304C	678 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	EMI1	YDR512C	564 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YFR054C	YFR054C	579 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YJR141W	YJR141W	1044 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	PAI3	YMR174C	207 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	MSN1	YOL116W	1149 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YOR277C	YOR277C	309 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	RPL20B	YOR312C	519 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	DBP10	YDL031W	2988 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	POL3	YDL102W	3294 nt		3.19	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	PSY2	YNL201C	2577 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	NOP12	YOL041C	1380 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	PRE1	YER012W	597 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	MPO1	YGL010W	525 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YGR018C	YGR018C	330 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	MVB12	YGR206W	306 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	TCD1	YHR003C	1290 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	GIC1	YHR061C	945 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	PCL5	YHR071W	690 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YIL054W	YIL054W	318 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	MCR1	YKL150W	909 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	CDC123	YLR215C	1083 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	ADI1	YMR009W	540 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YBL065W	YBL065W	345 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YNL089C	YNL089C	477 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	RPA190	YOR341W	4995 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	MDM1	YML104C	3384 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		3.18	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	SOK1	YDR006C	2706 nt		3.17	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	RIF1	YBR275C	5751 nt		3.17	□□□□□ -1.9
YKL050C	P35736	VEL1	YGL258W	621 nt		3.17	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.9 ms