Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PNPLA3Q9NST1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms