Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASS4Q9NQ75 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms