Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC82Q8N4S0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms