Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
WDR53Q7Z5U6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
WDR53Q7Z5U6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms