Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP3Q6Q6R5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRIP3Q6Q6R5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms