Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SS18Q15532 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SS18Q15532 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SS18Q15532 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SS18Q15532 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SS18Q15532 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SS18Q15532 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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SS18Q15532 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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SS18Q15532 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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SS18Q15532 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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SS18Q15532 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SS18Q15532 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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SS18Q15532 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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SS18Q15532 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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SS18Q15532 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SS18Q15532 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SS18Q15532 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SS18Q15532 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SS18Q15532 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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