Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 CBP1YJL209W 1965 nt5.79□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt5.79□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 FLC3YGL139W 2409 nt5.79□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 SWP82YFL049W 1872 nt5.79□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 PHO2YDL106C 1680 nt5.79□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 THI21YPL258C 1656 nt5.79□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 ECM34YHL043W 513 nt5.78□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 YBL044WYBL044W 369 nt5.78□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt5.78□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 FEX2YPL279C 1128 nt5.78□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 MRPL51YPR100W 423 nt5.78□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 COG8YML071C 1824 nt5.78□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 PMT5YDL093W 2232 nt5.78□□□□□ -1.48
NCR1Q12200 RPP1AYDL081C 321 nt5.77□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 RPL35AYDL191W 363 nt5.77□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 POG1YIL122W 1056 nt5.77□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 CNB1YKL190W 528 nt5.77□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 snR13snR13 124 nt5.77□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 BYE1YKL005C 1785 nt5.77□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 HOF1YMR032W 2010 nt5.77□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 BIT61YJL058C 1632 nt5.77□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 SRP101YDR292C 1866 nt5.77□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 SIT1YEL065W 1887 nt5.77□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 EPS1YIL005W 2106 nt5.77□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 AVO1YOL078W 3531 nt5.77□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 IMD2YHR216W 1572 nt5.76□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 CWC21YDR482C 408 nt5.76□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 YLR053CYLR053C 327 nt5.76□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 GSY2YLR258W 2118 nt5.76□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 PPG1YNR032W 1107 nt5.76□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 VAM10YOR068C 345 nt5.76□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 PUS1YPL212C 1635 nt5.76□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 MNN1YER001W 2289 nt5.76□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 HXT5YHR096C 1779 nt5.75□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 SEC27YGL137W 2670 nt5.75□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 YAP1YML007W 1953 nt5.75□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 PRP42YDR235W 1635 nt5.75□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 UTP25YIL091C 2166 nt5.75□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 PRE8YML092C 753 nt5.75□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 SRL1YOR247W 633 nt5.75□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt5.74□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 RPS27BYHR021C 249 nt5.74□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 YKL069WYKL069W 543 nt5.74□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 MRPL33YMR286W 261 nt5.74□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 REI1YBR267W 1182 nt5.74□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 PHO84YML123C 1764 nt5.74□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 MAL11YGR289C 1851 nt5.74□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 EXO70YJL085W 1872 nt5.74□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 ACC1YNR016C 6702 nt5.73□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 YOS1YER074W-A 258 nt5.73□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 PEX11YOL147C 711 nt5.73□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 YPR063CYPR063C 423 nt5.73□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 VPS27YNR006W 1869 nt5.73□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 DBP6YNR038W 1890 nt5.73□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 FAT3YKL187C 2253 nt5.72□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 PMP2YEL017C-A 132 nt5.72□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 YHL041WYHL041W 450 nt5.72□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 RPS17AYML024W 411 nt5.72□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt5.72□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 MGR1YCL044C 1254 nt5.72□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 ATG1YGL180W 2694 nt5.72□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 BUD14YAR014C 2130 nt5.72□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 MDM30YLR368W 1797 nt5.72□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 UBP7YIL156W 3216 nt5.72□□□□□ -1.49
NCR1Q12200 HOYDL227C 1761 nt5.71□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 ECT1YGR007W 972 nt5.71□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YHL042WYHL042W 453 nt5.71□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt5.71□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YAR068WYAR068W 486 nt5.71□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YBR224WYBR224W 516 nt5.71□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 ATG20YDL113C 1923 nt5.7□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 OXP1YKL215C 3861 nt5.7□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 MPH2YDL247W 1830 nt5.7□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 OPI6YDL096C 327 nt5.7□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 RPS13YDR064W 456 nt5.7□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 SCW4YGR279C 1161 nt5.7□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 PET191YJR034W 327 nt5.7□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YLR012CYLR012C 300 nt5.7□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 SIP18YMR175W 240 nt5.7□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 SWD3YBR175W 948 nt5.7□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 GAL10YBR019C 2100 nt5.69□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 VPS64YDR200C 1815 nt5.69□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 DBF20YPR111W 1695 nt5.69□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 SMI1YGR229C 1518 nt5.69□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 GPB1YOR371C 2694 nt5.69□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YBR184WYBR184W 1572 nt5.69□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5.69□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 VEL1YGL258W 621 nt5.69□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 COX18YGR062C 951 nt5.69□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.69□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YKL223WYKL223W 333 nt5.69□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 snR46snR46 197 nt5.69□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 BIT2YBR270C 1638 nt5.69□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 NRP1YDL167C 2160 nt5.68□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 snR61snR61 90 nt5.68□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YDL228CYDL228C 642 nt5.68□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YIL102CYIL102C 306 nt5.68□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YLR076CYLR076C 423 nt5.68□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 YNL276CYNL276C 396 nt5.68□□□□□ -1.5
NCR1Q12200 PIN3YPR154W 648 nt5.68□□□□□ -1.5
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