Protein–RNA interactions for Protein: Q05043

RSF1, Respiration factor 1, yeast

Predictions only

Length 376 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSF1	Q05043	MSN1	YOL116W	1149 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	DPB3	YBR278W	606 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	MUS81	YDR386W	1899 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	TAF2	YCR042C	4224 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	EPL1	YFL024C	2499 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	NCB2	YDR397C	441 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	SLD5	YDR489W	885 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	PEA2	YER149C	1263 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	SAE2	YGL175C	1038 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	ANB1	YJR047C	474 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	SHH3	YMR118C	591 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	NOP4	YPL043W	2058 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	STP2	YHR006W	1626 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YNL284C-A	YNL284C-A	1323 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	JJJ1	YNL227C	1773 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	ANR2	YKL047W	1551 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	MAK21	YDR060W	3078 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	OPI6	YDL096C	327 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YGL082W	YGL082W	1146 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YHR028W-A	YHR028W-A	321 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	RPS21B	YJL136C	264 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YNL122C	YNL122C	348 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	RFC3	YNL290W	1023 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	SRP68	YPL243W	1800 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	HBT1	YDL223C	3141 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YPS6	YIR039C	1614 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	EXO84	YBR102C	2262 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	RPA135	YPR010C	3612 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YER046W-A	YER046W-A	330 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YGL159W	YGL159W	1113 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YIL029C	YIL029C	429 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YLR076C	YLR076C	423 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YKE2	YLR200W	345 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	MRPL44	YMR225C	297 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	GRE2	YOL151W	1029 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YPR145C-A	YPR145C-A	237 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	CMD1	YBR109C	444 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	TCP1	YDR212W	1680 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	EAP1	YKL204W	1899 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YMR018W	YMR018W	1545 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	BNI4	YNL233W	2679 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	RTT105	YER104W	627 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	CIC1	YHR052W	1131 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YMR144W	YMR144W	1029 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	SWS2	YNL081C	432 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YNL203C	YNL203C	612 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YPL205C	YPL205C	345 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	LTP1	YPR073C	486 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	FLO9	YAL063C	3969 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	MSR1	YHR091C	1932 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	PFK26	YIL107C	2484 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YNR063W	YNR063W	1824 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	ERG11	YHR007C	1593 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	VAS1	YGR094W	3315 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	PEX6	YNL329C	3093 nt		3.16	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	FUS2	YMR232W	2034 nt		3.15	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	NUP60	YAR002W	1620 nt		3.15	□□□□□ -1.9
RSF1	Q05043	YDL187C	YDL187C	330 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	YGR045C	YGR045C	363 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	YIL068W-A	YIL068W-A	384 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	RPL17B	YJL177W	555 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	DIA2	YOR080W	2199 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	DUF1	YOL087C	3351 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	SPA2	YLL021W	4401 nt		3.15	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	YHR080C	YHR080C	4038 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	MAK5	YBR142W	2322 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	ASI3	YNL008C	2031 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	NEL1	YHR035W	1893 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	POL4	YCR014C	1749 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	SWI1	YPL016W	3945 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	FMN1	YDR236C	657 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	YER165C-A	YER165C-A	357 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	YGR042W	YGR042W	816 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	AGE2	YIL044C	897 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	SDO1	YLR022C	753 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	SRL1	YOR247W	633 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	RIX1	YHR197W	2292 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	YTA7	YGR270W	4140 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	LST4	YKL176C	2487 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	YDR034C-D	YDR034C-D	5313 nt		3.14	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	AFR1	YDR085C	1863 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	YKL075C	YKL075C	1353 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	AVT5	YBL089W	1380 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	NOP12	YOL041C	1380 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	LRP1	YHR081W	555 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	YHR213W	YHR213W	597 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	YIR020C-B	YIR020C-B	735 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	ASG7	YJL170C	630 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	EAF6	YJR082C	342 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	APC9	YLR102C	798 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	YAR062W	YAR062W	597 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	YLR264C-A	YLR264C-A	117 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	ATP18	YML081C-A	180 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	RPC40	YPR110C	1008 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	snR35	snR35	204 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	SPR3	YGR059W	1539 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	SHQ1	YIL104C	1524 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	PSK1	YAL017W	4071 nt		3.13	□□□□□ -1.91
RSF1	Q05043	RGL1	YPL066W	1440 nt		3.12	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.6 ms