Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ARID3CA6NKF2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ARID3CA6NKF2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 377.9 ms