Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NDUFA12Q9UI09 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NDUFA12Q9UI09 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms