Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CGGBP1Q9UFW8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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