Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM106CQ9BVX2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms