Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HIF1AQ16665 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIF1AQ16665 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HIF1AQ16665 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HIF1AQ16665 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIF1AQ16665 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIF1AQ16665 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIF1AQ16665 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HIF1AQ16665 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIF1AQ16665 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIF1AQ16665 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIF1AQ16665 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIF1AQ16665 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIF1AQ16665 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIF1AQ16665 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HIF1AQ16665 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIF1AQ16665 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIF1AQ16665 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIF1AQ16665 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HIF1AQ16665 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIF1AQ16665 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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