Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 NOP12YOL041C 1380 nt3.34□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 TFB2YPL122C 1542 nt3.34□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 SNT1YCR033W 3681 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YCR013CYCR013C 648 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 FAP7YDL166C 594 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YDL187CYDL187C 330 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 NCB2YDR397C 441 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 RPL1BYGL135W 654 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 BCD1YHR040W 1101 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 LRP1YHR081W 555 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 MRP8YKL142W 660 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 RAD33YML011C 534 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YMR087WYMR087W 855 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 IGO1YNL157W 507 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 RPL1AYPL220W 654 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 APD1YBR151W 951 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YPR022CYPR022C 3402 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 SHQ1YIL104C 1524 nt3.33□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 VIP1YLR410W 3441 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YDR114CYDR114C 303 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YDR199WYDR199W 366 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 VPS74YDR372C 1038 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 GRX2YDR513W 432 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 MIG3YER028C 1185 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 PRM8YGL053W 714 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 NNF1YJR112W 606 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YET1YKL065C 621 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YKL070WYKL070W 510 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 RPC37YKR025W 849 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 ECM4YKR076W 1113 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 RNH203YLR154C 333 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YLR400WYLR400W 474 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 RPL13BYMR142C 600 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 HFD1YMR110C 1599 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 MSR1YHR091C 1932 nt3.32□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YBP2YGL060W 1926 nt3.31□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 AFR1YDR085C 1863 nt3.31□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 EXO5YBR163W 1758 nt3.31□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 PSF1YDR013W 627 nt3.31□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt3.31□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 COQ9YLR201C 783 nt3.31□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 VAM10YOR068C 345 nt3.31□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 WHI3YNL197C 1986 nt3.31□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 HEF3YNL014W 3135 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 SNU56YDR240C 1479 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 SMT3YDR510W 306 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YFL015CYFL015C 495 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 AGA2YGL032C 264 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 RPS23AYGR118W 438 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 RGI2YIL057C 495 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 MRP49YKL167C 414 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 ATP18YML081C-A 180 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YNL276CYNL276C 396 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 FYV12YOR183W 390 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 LEE1YPL054W 906 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 RPS23BYPR132W 438 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 SUS1YBR111W-A 291 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YLR352WYLR352W 2424 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 SMC3YJL074C 3693 nt3.3□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 PKP2YGL059W 1476 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 RUD3YOR216C 1455 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 PEX1YKL197C 3132 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 PHO81YGR233C 3537 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 NEL1YHR035W 1893 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YNR063WYNR063W 1824 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 VMA8YEL051W 771 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 RTR1YER139C 681 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 FMP32YFL046W 624 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 SPO13YHR014W 876 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 GOT1YMR292W 417 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 GCY1YOR120W 939 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 AUS1YOR011W 4185 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 STU2YLR045C 2667 nt3.29□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 SEC27YGL137W 2670 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 VTC4YJL012C 2166 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 NDC80YIL144W 2076 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 FAR7YFR008W 666 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 COX13YGL191W 390 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YKT6YKL196C 603 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 RAD14YMR201C 1116 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 GIS2YNL255C 462 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 ATG3YNR007C 933 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 RPS7AYOR096W 573 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 ALG14YBR070C 714 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 YPR053CYPR053C 456 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 VBA4YDR119W 2307 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 ARP4YJL081C 1470 nt3.28□□□□□ -1.88
UBX3Q12229 KRI1YNL308C 1776 nt3.28□□□□□ -1.89
UBX3Q12229 MTR4YJL050W 3222 nt3.27□□□□□ -1.89
UBX3Q12229 YKL075CYKL075C 1353 nt3.27□□□□□ -1.89
UBX3Q12229 SEA4YBL104C 3117 nt3.27□□□□□ -1.89
UBX3Q12229 RRP42YDL111C 798 nt3.27□□□□□ -1.89
UBX3Q12229 HLR1YDR528W 1272 nt3.27□□□□□ -1.89
UBX3Q12229 SAE2YGL175C 1038 nt3.27□□□□□ -1.89
UBX3Q12229 YGR228WYGR228W 345 nt3.27□□□□□ -1.89
UBX3Q12229 RPL16AYIL133C 600 nt3.27□□□□□ -1.89
UBX3Q12229 RPL17BYJL177W 555 nt3.27□□□□□ -1.89
UBX3Q12229 TDA1YMR291W 1761 nt3.27□□□□□ -1.89
UBX3Q12229 LRG1YDL240W 3054 nt3.26□□□□□ -1.89
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