Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP3Q6Q6R5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.6 ms