Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL24A1Q17RW2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL24A1Q17RW2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
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