Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME3Q16798 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME3Q16798 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME3Q16798 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME3Q16798 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME3Q16798 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME3Q16798 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME3Q16798 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ME3Q16798 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME3Q16798 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME3Q16798 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME3Q16798 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME3Q16798 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME3Q16798 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME3Q16798 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME3Q16798 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME3Q16798 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ME3Q16798 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME3Q16798 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME3Q16798 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME3Q16798 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME3Q16798 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME3Q16798 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME3Q16798 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME3Q16798 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME3Q16798 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME3Q16798 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME3Q16798 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME3Q16798 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME3Q16798 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME3Q16798 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME3Q16798 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ME3Q16798 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ME3Q16798 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ME3Q16798 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME3Q16798 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME3Q16798 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME3Q16798 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME3Q16798 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME3Q16798 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME3Q16798 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME3Q16798 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME3Q16798 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ME3Q16798 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME3Q16798 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME3Q16798 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME3Q16798 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME3Q16798 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME3Q16798 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME3Q16798 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME3Q16798 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME3Q16798 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME3Q16798 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ME3Q16798 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME3Q16798 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME3Q16798 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME3Q16798 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME3Q16798 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME3Q16798 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME3Q16798 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME3Q16798 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME3Q16798 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME3Q16798 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME3Q16798 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME3Q16798 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME3Q16798 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME3Q16798 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME3Q16798 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME3Q16798 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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