Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID2Q14112 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID2Q14112 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID2Q14112 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID2Q14112 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID2Q14112 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NID2Q14112 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NID2Q14112 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NID2Q14112 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NID2Q14112 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NID2Q14112 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NID2Q14112 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NID2Q14112 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NID2Q14112 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NID2Q14112 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NID2Q14112 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID2Q14112 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID2Q14112 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID2Q14112 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID2Q14112 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID2Q14112 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID2Q14112 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID2Q14112 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID2Q14112 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID2Q14112 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID2Q14112 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID2Q14112 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID2Q14112 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NID2Q14112 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NID2Q14112 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NID2Q14112 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NID2Q14112 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NID2Q14112 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NID2Q14112 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NID2Q14112 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NID2Q14112 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NID2Q14112 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NID2Q14112 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NID2Q14112 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NID2Q14112 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NID2Q14112 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NID2Q14112 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NID2Q14112 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NID2Q14112 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NID2Q14112 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NID2Q14112 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NID2Q14112 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NID2Q14112 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NID2Q14112 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NID2Q14112 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID2Q14112 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID2Q14112 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID2Q14112 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID2Q14112 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID2Q14112 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID2Q14112 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID2Q14112 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID2Q14112 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID2Q14112 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID2Q14112 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID2Q14112 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NID2Q14112 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NID2Q14112 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NID2Q14112 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NID2Q14112 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NID2Q14112 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NID2Q14112 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms