Protein–RNA interactions for Protein: Q12329

HSP42, Heat shock protein 42, yeastyeast

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSP42Q12329 BUD21YOR078W 645 nt3.16□□□□□ -1.9
HSP42Q12329 PEX27YOR193W 1131 nt3.16□□□□□ -1.9
HSP42Q12329 DPB3YBR278W 606 nt3.16□□□□□ -1.9
HSP42Q12329 VTC4YJL012C 2166 nt3.16□□□□□ -1.9
HSP42Q12329 CWC22YGR278W 1734 nt3.16□□□□□ -1.9
HSP42Q12329 ADY4YLR227C 1482 nt3.16□□□□□ -1.9
HSP42Q12329 PIG2YIL045W 1617 nt3.15□□□□□ -1.9
HSP42Q12329 VPS33YLR396C 2076 nt3.15□□□□□ -1.9
HSP42Q12329 VHR2YER064C 1518 nt3.15□□□□□ -1.9
HSP42Q12329 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.15□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YGR017WYGR017W 894 nt3.15□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 MRPL9YGR220C 810 nt3.15□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 DAD2YKR083C 402 nt3.15□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 snR24snR24 89 nt3.15□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 SWD3YBR175W 948 nt3.15□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 IRC3YDR332W 2070 nt3.15□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 DSF2YBR007C 2211 nt3.15□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 SHQ1YIL104C 1524 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YSP2YDR326C 4317 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 PBS2YJL128C 2007 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 MRH1YDR033W 963 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 ATC1YDR184C 885 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 RTT105YER104W 627 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 NSA2YER126C 786 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 SMX2YFL017W-A 234 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 GPX1YKL026C 504 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YSF3YNL138W-A 258 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 BEM4YPL161C 1902 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 AI2Q0055 2565 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 FLO5YHR211W 3228 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YCL019WYCL019W 5313 nt3.14□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 ARO1YDR127W 4767 nt3.13□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 RPL13AYDL082W 600 nt3.13□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 MIG2YGL209W 1149 nt3.13□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 GOS1YHL031C 672 nt3.13□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.13□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YJL114WYJL114W 681 nt3.13□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt3.13□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 RPC25YKL144C 639 nt3.13□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 MRPL38YKL170W 417 nt3.13□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 AFT2YPL202C 1251 nt3.13□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 ESA1YOR244W 1338 nt3.13□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YPD1YDL235C 504 nt3.12□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 NRG1YDR043C 696 nt3.12□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 RPL30YGL030W 318 nt3.12□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YHR180WYHR180W 492 nt3.12□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 FAR3YMR052W 615 nt3.12□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YNL043CYNL043C 321 nt3.12□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 TSR4YOL022C 1227 nt3.12□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 MGE1YOR232W 687 nt3.12□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 LTP1YPR073C 486 nt3.12□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 KAR4YCL055W 1008 nt3.12□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 CAF120YNL278W 3183 nt3.12□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 SKT5YBL061C 2091 nt3.12□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 SKO1YNL167C 1944 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YDR250CYDR250C 276 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 VAB2YEL005C 849 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YFH7YFR007W 1062 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 BTN2YGR142W 1233 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 PHD1YKL043W 1101 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YLR050CYLR050C 486 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 VMA6YLR447C 1038 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 RPL6BYLR448W 531 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 MER1YNL210W 813 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 CAT5YOR125C 702 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 AEP1YMR064W 1557 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 GEA1YJR031C 4227 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YMR046CYMR046C 1323 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.11□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 ARP4YJL081C 1470 nt3.1□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 JIP5YPR169W 1479 nt3.1□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 FUN30YAL019W 3396 nt3.1□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YFL012WYFL012W 447 nt3.1□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 GCY1YOR120W 939 nt3.1□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 SPR2YOR214C 711 nt3.1□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 CMD1YBR109C 444 nt3.1□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 snR35snR35 204 nt3.1□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 PEX6YNL329C 3093 nt3.1□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 CWH41YGL027C 2502 nt3.1□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 ARP5YNL059C 2268 nt3.09□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YBP2YGL060W 1926 nt3.09□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 CDC55YGL190C 1581 nt3.09□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 NUP60YAR002W 1620 nt3.09□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 STE2YFL026W 1296 nt3.09□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 RPL17BYJL177W 555 nt3.09□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 CPR7YJR032W 1182 nt3.09□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 RPA12YJR063W 378 nt3.09□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 YKL115CYKL115C 393 nt3.09□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 INO4YOL108C 456 nt3.09□□□□□ -1.91
HSP42Q12329 ATP20YPR020W 348 nt3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.8 ms