Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPC1P11940 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PABPC1P11940 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms